Да, можно на машину с Win 98 поставить сервер защиты как приложение.
Только не разворачивайте на ней саму базу - в Win 98 есть ограничение на количество одновременно открытых файлов.
Только не разворачивайте на ней саму базу - в Win 98 есть ограничение на количество одновременно открытых файлов.